Когда Ниджат учился в четвёртом классе, его семья переехала в Баку, где Ниджат записался в Республиканский Олимпийский спортивный лицей. Сначала Ниджат Шихализаде ходил на гимнастику, но не любил этот вид спорта. Ниджату нравилась борьба и поэтому он втайне от всех записался на дзюдо и перестал ходить на гимнастику.
Когда Ниджат начал заниматься дзюдо ему было 10 лет. Первым его тренером был Наги Бабаев. В 2004 году Ниджат Шихализаде становится чемпионом Европы среди юношей (до 17 лет), проходившем в Роттердаме (в весовой категории до 55 кг).
В следующем году в Тбилиси он становится обладателем Кубка мира, уже в новой для себя весовой категории до 60 кг. В этом же году Ниджат Шихализаде занимает третье место на чемпионате мира в Каире.
В сентябре 2005 года он стал победителем юношеского чемпионата Европы в Загребе (до 20 лет).
Но, по результатам допингового анализа у Ниджата в крови был выявлен запрещенный к использованию препарат. Этот препарат предназначался для искусственного снижения веса. По словам Шихализаде, это произошло по неопытности, и он не знал, что этот препарат нельзя использовать. В результате Ниджата Шихализаде исключили из международных турниров сроком на один год. Несмотря на это, он продолжал тренироваться.
Через год, в 2006 году в Санто-Доминго, Ниджат Шихализаде становится чемпионом мира среди юношей (до 20 лет). Затем в 2007 году он занимает второе место на проходившем в Риме Кубке мира и получает лицензию на участие в Олимпийских играх в Пекине.
Однако, в Минске, где спортсменов проверяли на использование запрещённых препаратов, выяснилось, что Ниджат употреблял этот препарат, несмотря на то, что в то время, по словам самого спортсмена, он его не использовал. Как заявляет Шихализаде, «в первый раз это было по неопытности, но во второй раз я на самом деле его не использовал».
В результате Ниджат Шихализаде был дисквалифицирован на 4 года и так и не смог принять участие в Пекинской Олимпиаде. По словам Ниджата Шихализаде, многие ожидали, что он уйдёт из спорта, но Ниджат продолжал тренироваться.
В 2011 году срок наказания истёк, и Ниджат Шихализаде получил право снова принимать участие в турнирах. Впервые после перерыва он принял участие на Кубке Европы в Гамбурге, в уже новой весовой категории, в 66 кг.
Затем, в 2012 году, он становится победителем соревнований Гран-при в Абу-Даби и обладателем Кубка Европы в Стамбуле. В настоящее время Ниджат Шихализаде является также офицером Пограничных Войск.
В 2014 году Шихализаде занимает первое место на турнире Гран-при в Тбилиси. В 2016 году принимал участие на летних Олимпийских играх 2016 в Рио-де-Жанейро, где в первой схватке победил Сугоя Уриарте из Испании, но затем проиграл итальянцу и будущему олимпийскому чемпиону Фабио Базиле.
В 2017 году стал бронзовым призёром чемпионата Европы и победителем Исламских игр солидарности в Баку. В этом же году принимал участие на чемпионате мира в Будапеште, где в первом же поединке уступил Елдосу Жумаканову из Казахстана.