С 1981 года стала учиться в Чаоянской спортшколе, в 1983 году попала в спецгруппу дзюдо.
В 1984 году Ли Чжунъюнь выиграла чемпионат КНР, в 1985 — чемпионат Азии.
На чемпионате мира 1986 года она завоевала лишь бронзовую медаль, но уже на чемпионате мира 1987 года стала золотой медалисткой.
На Олимпийских играх 1988 года в Сеуле она также боролась лучше всех, но в 1988 году женское дзюдо было лишь показательной дисциплиной, и победители в нём не считались олимпийскими чемпионами.
В 1990 году Ли Чжунъюнь стала чемпионкой Азиатских игр, в 1991 году завоевала бронзовую медаль чемпионата мира, а в на Олимпийских играх 1992 года в Барселоне она наконец завоевала олимпийскую медаль, но лишь бронзовую. В 1993 году Ли Чжунъюнь стала обладательницей серебряной медали Спартакиады народов КНР.